Daljnjim razvojem parlamentarne demokracije u RH, nastavljene su i reforme u sigurnosnom sustavu. Tako je 2002. donesen Zakon o sigurnosnim službama (u daljnjem tekstu ZOSS) kojim su u RH definirane tri službe – Protuobavještajna agencija (nekadašnji SZUP), Obavještajna agencija (nekadašnji HIS) te Vojno-sigurnosna agencija (nekadašnji SIS).
Protuobavještajna agencija (u daljnjem tekstu POA) planirala je i provodila protuobavještajno djelovanje u zemlji te prikupljala, analizirala, obrađivala i ocjenjivala podatke o djelovanju stranih obavještajnih službi kao i o djelovanju pojedinih osoba, skupina i organizacija na teritoriju Republike Hrvatske koja su usmjerena protiv nacionalne sigurnosti.
POA je sudjelovala u protuobavještajnoj zaštiti i skrbila za sigurnost zaštićenih osoba, objekata i prostora određenih odlukom Vlade, te važnijih skupova i sastanaka kada je to zatražila Vlada Republike Hrvatske.
Radi ostvarivanja protuobavještajne zaštite, POA je izrađivala sigurnosne provjere osoba kojima se povjeravaju tajni podaci i predmeti posebnog interesa, osoba koje takvim podacima i predmetima imaju pristup i osoba koje su zaposlene ili će se zaposliti u državnoj upravi i stručnim službama tijela državne vlasti te pravnih osoba na poslovima značajnim za nacionalnu sigurnost.
Ravnatelji POA-e od 2003. do 2006.
- pomoćnik ministra unutarnjih poslova / ravnatelj SZUP-a
od 11.02.2000. do 04.05.2003.,
a od 05.05.2003. do 14.03.2004.
ravnatelj POA-e
- ravnatelj POA-e
od 15.03.2004. do 11.12.2004.
- ravnatelj POA-e
od 11.12.2004. do 13.09.2006.